万历二十九年（公元一千六百零一年）利玛窦将《坤舆万国全图》献给万历皇帝，得到万历皇帝的称赞，还发给他大明官员的俸碌；内阁首辅叶向高接见了利玛窦，并与他下了一盘围棋，利玛窦在《利玛窦中国札记》中记录此事，这件事也是欧洲人对中国围棋的最早记录。
内阁首辅叶向高赠给利玛窦一首诗，《诗赠西国诸子》：“天地信无垠，小智安足拟。爰有西方人，来自八万里。言暮中华风，深契吾儒里。著书多格言，结交尽贤士。淑诡良不矜，熙攘乃所鄙。圣化被九埏，殊方表同轨。拘儒徒管窥，大观自一视。我亦与之游，冷然待深旨。”叶向高此首诗的手稿后来碾转来到欧洲，现存于法国国家图书馆。
后来利玛窦于万历三十八年（公元一千六百一十年）病逝于北京，按照大明制度规定，传教士死后都应该葬于澳门，不能够葬在京城。
接任利玛窦的传教士庞迪我向万历皇帝上奏章，力求让利玛窦葬于北京：“利玛窦以年老患病身故，情实可怜，况臣利玛窦自入圣朝，渐习熙明之化，读书通理，朝夕虔恭，焚香祝天，颂圣一念，犬马报恩忠赤之心，都城士民共知，非敢饰说。生前颇称好学，颇能著述，先在海邦，原系知名之士，及来上国，亦为缙绅所嘉？臣等外国微臣，悲其死无葬地，泣血祈恳天恩，查赐闲地亩余，或废寺闲房数间，俾异域遗骸得以埋瘗，而臣等见在四人，亦得生死相依，恪守教规，既享天朝乐土太平之福，亦毕蝼蚁外臣报效之诚。”
庞迪我在此封奏章中，称中国文明为熙明之化，大明王朝为天朝乐土，又将利玛窦和自己比作犬、马、蝼蚁，言词恭敬地表达了对中国文化及大明皇帝的敬意。万历皇帝念及利玛窦所献之《坤舆万国全图》有功劳，于是动了恻隐之心，并批准了庞迪我的要求，将利玛窦葬于北京西郊的藤公栅栏（今存于北京行政学院院内）。
言官曾经对万历皇帝批准利玛窦葬于北京的事，以“从来无此先例”为由，提出反对意见。叶向高慨然道：“自古来华洋人中，其道德学问，有一如利子乎？毋论其它事，即译《几何原本》一书，便宜赐葬地矣。”
利玛窦墓园现仍存有万历三十八年立的墓碑一座，碑文是:“利先生讳玛窦，号西泰，大西洋意大利亚国人。自幼入会真修，明万历壬辛年航海首入中华衍教，万历庚子年来都，万历庚戌年卒。在世五十九年，在会四十二年。”利玛窦也成为中国历史上首位葬于北京的西方传教士。利玛窦的著作不仅影响了中国人，也影响了同属中华文化圈的朝鲜，日本等国，日本作者平川佑弘在其所著《利玛窦传》就对其作了高度评价，称赞他是”世界公民！“、“人类历史上第一位集欧洲文艺复兴时期的诸种学艺，和中国四书五经等古典学问于一身的巨人。”
在胡子睿看来，这张《坤舆万国全图》已经非常接近于后世的世界地图了，而这张图本身是中西文化互相交流的产物，比如在这张图上的欧罗巴洲西班牙国，上面有注解文字:“(欧罗巴洲）去中国八万里，自古不通，今相通近七十余载云。“
利玛窦本身只活了五十九年，为耶稣会工作也只有四十二年的时间，怎么可能相通七十余载？更何况明朝后来一直在万历皇帝死后的隆庆时期才开海，利玛窦在地图上”原封不动“地引了用这段话，足以证明在他编制地图时，参考过不少前人编制的地图，这些图中很可能包括郑和当年下西洋的海图，从郑和下西洋的年代倒推七十余载，应该是蒙元时期，这倒是勉强可以对得上面这段话了。
在关于南美洲的地方还有一段文字也可以证明：“南亚墨利加今分为五邦，一曰孛露，以孛露河为名;二曰金加西蜡，以所产金银之甚多为名;三曰坡巴牙那，以大郡为名;四曰智里，古名;五曰伯西儿，即中国所谓苏木也“，旁边还有一段注文称:“伯西尔此古苏木“。胡子睿知道所谓苏木是明朝人对巴西的简称。
这些证据都有力证明了明朝对于整个世界都有清楚的认识，整体的文化范围是”包容并举“、”积极吸收先进科技知识；直到明朝末年，中国人的地理知识、制图水平并不比西方人落后太多；而到了满清执政时，由于他们狂妄自大的心态，导致对世界的认识出现了极大的倒退。
满清入关后，将《大明混一图》不分鉴别的全部贴上满文标鉴，以满足其并吞四海的虚荣心，直到第一次鸦片战争时，道光还不知道打败了自己的这个英吉利，毕竟在那里，光绪时的众臣徐桐在谈判时连西班牙、葡萄牙都不知道，还说这是英、法国胡编出来的，最后还得从几百年前明朝人的《坤舆万国全图》，找到准确的地理位置和海上航线。
在地球另一端的欧洲，提出日心说的伽利略受到教廷的迫害，被囚禁在家中；相比之下，明朝上至崇祯皇帝、下至徐光启这样的大臣，对于西方先进的科技文化，是那样“如饥似渴”的吸收、引进，崇祯皇帝在其执政晚期，那种极度困难的情况下，还命徐光启编辑《崇祯历书》；然而，直到明朝灭亡的时侯，牛顿还没有出生，科技发展的曙光还没有出现......
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