孙承宗曰：“再照臣抵关虽未敢议诛逃将，而心颇严之，如原任总兵李秉诚，数月来练火药几二万人，其勤敏有精思，是当录叙其新绩，不必从前追询其旧过，庶令臣所为操练诸将者将人人可鼓也。臣又念锦衣卫指挥陈居恭向议移臣居外，为台省论劾革任。居恭系臣同乡晚辈，或过信臣为力可当关而语无伦次，未必信人指授。况今臣既抵关，似宜复其原任，无令人谓臣一入纶扉，侵及邑子，又天慈所以庇臣也。”
杜应魁者，故辽东备御也，罢官，市酒长安，然其人实悍毅，可为战将。有物色之者，遂坐作声价，必欲得大将方出。给事韩继思荐为副总兵，招生。所招兵实多百金之上，而索厚糈，部执格不与，遂未免虚伍以养壮士。
后来兵部给孙承宗回了一封信，明确提出杜应魁须结清旧账才能放过：“看得年来东事孔棘，凡借名招募，骗官骗饷，实多奸党，更倚墙壁，虽缉拿之檄日下而抗骄之焰转炽，法纪至此，国家几无三尺矣。心切恨之，乃何物募练营兵?守备有如杜应魁者，虚负匹夫一剑之勇，无投石超距之能，招兵坝上，名虽八千，一查于山海道，而虚冒者二千有奇，再点于关院，而隐替者又五百有奇，月计岁计，糜饷几数万金。以乌有之军糈饱一己之谿壑，心无属厌，恬不畏法，贪弁中有如此胆大包天者乎？
况纵放军人，上盗行奸，杀人放火，若此无等，岂称有勇有谋？复再置之关外设防，岂能冲锋御敌，为封疆出死力哉？必须稽查兵数，究核侵欺，明白算结而后使过可也。至于柯仲炯以吚唔公子谈兵说剑，招结党棍；如吴文耀等领兵五千，强半逃亡；陈政以贾祥幕客呼朋引类，虚冒逃兵；周弘祖等矫命雄行，潜匿京邸，应究核者究核，应提拏者提拏，则又所当迅行严追，无事停留，以长奸宄可也。至于糜饷行劫，法自难贷，又非职言所敢越俎矣。”
孙承宗向皇上请命提拔袁崇焕为兵备副使、右参政，孙承宗毕竟老了，预感到自己在辽东不会呆太久，为了尽快培育袁崇焕的威望，孙承宗经常在召开会议时，把自己的想法提前告诉袁崇焕，而且，孙承宗在主持会议时，有意打乱发言顺序，让袁崇焕首先发表自己的见解，孙承宗进一步阐述袁崇焕说话中求尽之意，并采纳他的意见，使祖大寿、赵率教一般军中将士多听袁崇焕之言。
孙承宗临走之前推荐袁崇焕任宁前道兵备，对于孙承宗的这个安排，天启皇帝从之；根据大明制度，宁前兵备一员。春夏、驻札宁远。秋冬、驻札前屯。东至宁远(土答)山所、西至前屯中前所、抵关所辖、宁前二卫、城堡驿所、共三十二处。兼管屯田、马政；与与宁前道对应的是辽海东宁道：带管广宁、锦、义等处兵备。春夏、驻札锦州。秋冬、驻札义州。东至广宁、镇武、并西兴、西平、西宁、平洋等堡。西至锦州杏山驿。所辖广宁等九卫、城堡驿所、三十五处。兼管屯田、马政。宁前道兵备与辽海东宁道的分界处本在杏山，然而由于建虏崛起，此时的辽海东宁道已经“名存实亡”。
孙承宗又想到一个作战勇猛可助袁崇焕之人，此人乃是满桂，他生于万历二十二年（公元一千五百九十四年），宣府（今河北宣化）人，原籍山东兖州府峄县，以祖上有战功，世居宣府前卫。
满桂年稍长，便骑射。每从征，多斩馘（指割掉敌人的左耳，古代以此计数献功）。军令，获敌首一，予一官，否则给予白金五十。满桂屡得金，不受职。年及壮，始为总旗。又十余年为百户。后屡迁潮河川守备。杨镐四路师败，荐小将知兵者数人，首及满桂。移守黄土岭。为总督王象乾所知，进石塘路游击、喜峰口参将。
孙承宗行边之后，满桂入谒。孙承宗壮其貌，与满桂谈兵事，大奇之；孙承宗推荐满桂出镇山海，即擢副总兵，领中军事。孙承宗幕下，文武辐辏，独用满桂，满桂桂椎鲁甚，众皆窃笑之，然其忠勇绝伦，不好声色，与士卒“同甘共苦”。
当时，蒙古部落驻牧宁远东鄙，辽民来归者悉遭劫掠，孙承宗颇患之，遣满桂及总兵尤世禄袭之大凌河。诸部号泣西窜，东鄙以宁。拱兔、炒花、宰赛诸部阳受款而阴怀反侧。满桂善操纵，诸部咸服，岁省抚赏银不赀；宁远城中郭外，一望丘墟。至是军民五万余家，屯种远至五十里。孙承宗上其功。诏擢满桂为都督佥事，加衔总兵。孙承宗更令满桂典后部，与前部赵率教相掎角。
督饷郎中杨呈秀侵克军粮，副将徐涟激起兵变，围攻袁崇焕办公府署，孙承宗命满桂前往，众兵忌惮满桂家丁之勇猛，不敢侵犯，遂结队东走。孙承宗命袁崇焕与满桂追斩首恶，抚余众而还。孙承宗又令袁崇焕、满桂筑宁远城，满桂度中朝不能远守，筑仅十一，且疏薄不中程；袁崇焕乃定规制：高三丈二尺，雉高六尺，址广三丈，上二丈四尺，袁崇焕还曾经亲自与满桂、祖大寿人一起筑城。
经此事后，满桂与袁可焕合作无间。袁崇焕经过孙承宗种种历练，长进很大。尽管如此，孙承宗仍然觉得他当个巡抚尚可，如果担任总督一级的大臣还欠些火候；孙承宗深知茅元仪对铸炮、防守方面很有讲究，一旦战事兴起，颇有作用，于是极力挽留茅元仪辅佐袁崇焕，茅元仪也不想逗留在辽东逗留，他坦言已将红夷大炮的使用方法传授于袁崇焕的家人，孙承宗见茅元仪去意已决，也就不再挽留了；。
孙承宗把自己认为能做的事情都已经做完了，于是回到高阳县自己的老家，过上了门无宾客，室无媵侍，居无玩好，出无舆从。危椽老屋，吃饭事酒，丛书散逸，篝灯讲诵，夏扇冬炉，孙子夹侍，整襟危坐，俨如图刻的逍遥生活。